from
Genomic signature using FCGR
by Jesús P. Mena-Chalco
Genomic signature using Chaos game representation of frequencies.
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| readFastaFile(fastaFile)
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function sequence = readFastaFile(fastaFile)
% Funcin que permite leer una secuencia de ADN dado en formato FASTA
fastaArray = textread(fastaFile,'%s');
% desconsideramos los comentarios ">"
i=1; while (strmatch('>',fastaArray(i))) i=i+1; end;
% fastaArray es un vector donde cada elemento corresponde a una
% lnea del archivo fasta. Para eliminar los quiebres de linea
% fue creada una funcin que permita construir una cinta (strand)
% de la secuencia de ADN
sequence = buildDNAStrand(fastaArray(i:end));
end
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