2021小迈步第五课：使用MATLAB处理生物信息学问题

概述

生物信息学，作为一个基于生物、数学和计算机专业的交叉学科，正在经历一个爆炸式的发展。随着下一代测序技术（Next-Generation Sequencing）的问世，生物信息学也正在面临数据源复杂，数据量庞大等诸多挑战。

本次讲座，我们首次聚焦生物信息学, 使用一些具体实例向您介绍如何使用MATLAB中的Bioinformatics Toolbox对生物信息学数据进行导入、分析以及可视化。我们也会向您介绍如何如何发挥MATLAB集成平台的优势，与其他工具箱结合，高效地解决我们研究过程中遇到的诸多挑战。

讲座亮点包括：

• Bioinformatics Toolbox基本功能简介
• 标准文件格式读取及在线数据库导入
• NGS数据的处理及分析
• 数据可视化及部署
• MATLAB与其他开源工具的比较

背景知识：

Bioinformatics Toolbox™ 提供一系列算法和 App，可用于下一代测序技术 (NGS)、微阵列分析、质谱分析法和基因本体论。您可以使用工具箱函数，从标准文件格式（如 SAM、FASTA、CEL 和 CDF）以及在线数据库（如 NCBI Gene Expression Omnibus 和 GenBank^®）读取基因组和蛋白质组数据。您可利用序列浏览器、空间热图和聚类图探查和可视化此类数据。该工具箱还提供了用于检测峰值、针对缺失数据输入值和选择特征的统计方法。

关于演示者

许悦伊，MathWorks中国高校团队工程师，主要负责高校合作与教师的教学及科研工作。曾从事分子动力学仿真相关研究工作。美国德州理工大学化学工程专业博士。