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Matlabでの医用​画像(dcmファイル​)による分類器の作り​方

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ssk
ssk on 30 Jan 2019
Commented: Kazuya on 1 Feb 2019
Matlabにて大量の医用画像(dcmファイル)を用いて分類器の作成を検討しております。
参考となるスライドやソースコードなどございましたら、ご教示いただけますと幸いです。

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Kazuya Machida
Kazuya Machida on 31 Jan 2019
こちらの動画等はすでに確認されていますでしょうか?
ビデオ途中にディープラーニングを使った分類があります。
【医用画像を題材とした3次元画像解析とディープラーニング】
※スライド等はページ内のリンクからダウンロード可能です。
その他、活用いただけそうな関数
【DICOM ファイルからのイメージ データの読み取り】
【k-meansを使った3次元画像データのセグメンテーション】※R2018bより追加

  4 Comments

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Kazuya
Kazuya on 31 Jan 2019
classification であればまずは AlexNet を使用した転移学習 のサンプルから始めるといいのかなと。
問題になるのは DICOM 画像である点ですが、
で類似の質問がありました。回答にもある通り
1:Kazuya Machida さんがコメントくださった方法で DICOM 画像を読み取り、PNGなどの一般的な画像フォーマットで保存しなおす
2:DICOM 画像をそのまま読み込むようにする
の2つの方法があるかと思います。1の方がサンプルをそのまま転用しやすいかとは思いますが、
imds = imageDatastore(imageDir, 'FileExtensions','.dcm','ReadFcn',@readDicomDatastoreImage);
という風に(注:このままでは動きません) imageDatastore で DICOM 画像を読み取る手法の方がスマート?な気はしますね。。
ssk
ssk on 31 Jan 2019
Kazuyaさま
ご回答誠にありがとうございます。DICOM画像の変換の件、ご示唆を頂きまして誠にありがとうございました。
DICOM画像をそのまま扱うのは大変そうですので、PNGファイルへの変換を検討いたします。
また、classificationの参考となりそうなリンクを見つけたのでこちらをもとに取り組んでみたいと思います。
https://jp.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/55107-brain-mri-tumor-detection-and-classification
Kazuya
Kazuya on 1 Feb 2019
Good luck :)

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